科学者らが生成AIを使ってDNA編集用のより優れたタンパク質を構築

研究者らは31,565の真核生物ゲノムを検索し、116,000以上の潜在的なPiggyBacトランスポザーゼ配列を同定した後、23の天然候補タンパク質をヒト細胞で試験し、9つが検出可能な活性を示し、2つが以前に実験室進化で最適化されたHyPBと同等の性能を示した。次に、13,000以上の生物探査配列でタンパク質言語モデルProGen2を微調整し、100,000以上の合成変異体を生成し、そのうち22を試験した。すべてが切除活性を示し、7つがHyPBよりも有意に高いDNA切除活性を示した。1つの変異体である配列3277は、FiCAT遺伝子編集システムに組み込むと培養細胞における標的DNA挿入を2倍にした。初代ヒトT細胞では、異なるタンパク質が異なるタスクで最高の性能を示し、Poeturと配列136はHyPBよりも高い非標的組み込みを達成し、配列3277はHyPBと同様の性能を示した。著者らは、活性の向上が精度や安全性の向上を保証するものではなく、特異性と治療効果についてはさらなる研究が必要であると警告している。

(出典：The Brighter Side of News)