Científicos utilizan IA generativa para construir mejores proteínas para editar ADN
Investigadores usaron IA generativa y minería genómica para diseñar variantes de la transposasa PiggyBac que duplicaron la inserción dirigida de ADN en células cultivadas.Resumen
Los investigadores buscaron en 31,565 genomas eucariotas y identificaron más de 116,000 secuencias potenciales de la transposasa PiggyBac, luego probaron 23 candidatos naturales en células humanas, encontrando nueve con actividad detectable y dos comparables a una versión previamente optimizada, HyPB. Después, ajustaron el modelo de lenguaje de proteínas ProGen2 con más de 13,000 secuencias bioprospectadas, generando más de 100,000 variantes sintéticas de las cuales probaron 22; todas mostraron actividad de escisión y siete superaron significativamente a HyPB. Una variante, la secuencia 3277, duplicó la inserción dirigida de ADN cuando se incorporó al sistema de edición génica FiCAT en células cultivadas. En células T humanas primarias, diferentes proteínas rindieron mejor en distintas tareas: Poetur y la secuencia 136 lograron una mayor integración no dirigida que HyPB, mientras que la secuencia 3277 rindió de forma similar a HyPB. Los autores advierten que una mayor actividad no garantiza mejor precisión o seguridad, y que la especificidad y la eficacia terapéutica requieren más investigación.
(Fuente：The Brighter Side of News)