科学家利用生成式人工智能构建更好的DNA编辑蛋白质
内容摘要
研究人员搜索了31,565个真核生物基因组，识别出超过116,000个潜在的PiggyBac转座酶序列，随后在人类细胞中测试了23个天然候选蛋白，发现9个具有可检测活性，其中2个与先前通过实验室进化优化的HyPB性能相当。接着，他们用超过13,000条生物勘探序列对蛋白质语言模型ProGen2进行微调，生成了超过100,000个合成变体，并测试了其中22个；所有变体均显示出切除活性，其中7个的DNA切除活性显著优于HyPB。其中一个变体——序列3277——在FiCAT基因编辑系统中使培养细胞中的靶向DNA插入效率翻倍。在原发性人类T细胞中，不同蛋白质在不同任务中表现最佳：Poetur和序列136的非靶向整合率高于HyPB，而序列3277的表现与HyPB相似。作者提醒，活性提高并不保证精确性或安全性更好，特异性和治疗效果仍需进一步研究。
(来源：The Brighter Side of News)